Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms