Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C9orf72Q96LT7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms