Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCZQ96LD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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