Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGLYRP3Q96LB9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms