Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMNQ96JQ2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMNQ96JQ2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMNQ96JQ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLMNQ96JQ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLMNQ96JQ2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLMNQ96JQ2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms