Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms