Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms