Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
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