Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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