Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms