Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN4Q92575 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms