Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A3Q92570 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A3Q92570 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms