Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
U2AF1L4Q8WU68 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L4Q8WU68 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms