Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC38A9Q8NBW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A9Q8NBW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms