Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM87AQ8NBN3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms