Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AVL9Q8NBF6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms