Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSL3Q8N5Y2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms