Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf62Q8N4C0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms