Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRX1Q86UT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms