Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms