Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q71RC1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q71RC1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q71RC1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q71RC1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q71RC1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q71RC1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q71RC1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms