Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms