Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms