Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST4

LCNL1, Lipocalin-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCNL1Q6ZST4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCNL1Q6ZST4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms