Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCD1Q6ZMY3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms