Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms