Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARP1Q6PKG0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARP1Q6PKG0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms