Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms