Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC62Q6P9F0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC62Q6P9F0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms