Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KANK3Q6NY19 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANK3Q6NY19 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms