Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms