Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCTN3Q6NUS6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCTN3Q6NUS6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms