Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL3Q6DD88 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms