Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms