Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GARNL3Q5VVW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms