Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms