Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HES3Q5TGS1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms