Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms