Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR44Q5JSH3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms