Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAVIN4Q5BKX8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAVIN4Q5BKX8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms