Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms