Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms