Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms