Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms