Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC39A12Q504Y0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms