Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP13A4Q4VNC1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms