Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF3Q496Y0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF3Q496Y0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms