Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWC2Q2TAL6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms