Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms