Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP6Q16828 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP6Q16828 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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